台湾研究院文献信息中心是大陆收藏台版文献资料的重镇。经过40多年艰难困苦的积累，现有馆藏台版图书近7万册，其中外文图书8千余册；200多种过刊装订本近2万册、20多种往年报纸装订本0.9万册。目前每年订购台湾地区出版的图书近千册，期刊近100种，报纸5种。
进入21世纪以来，随着文献载体的不断革新，台湾研究院充分利用现有资源，有针对性地采购各类电子资料库，并积极建设特色数据库。目前，本中心拥有联合百科系列数据库4种、汉珍数位台湾研究系列14种、台港澳资源检索系统（期刊近2000种，全文74万篇，学位论文近45万篇，每年更新）、台湾研究基础数据库（台湾统计数据、选举数据）、《台湾研究集刊》检索光盘等电子资源20余种，为本校以及大陆台湾研究手段与技术的创新提供了有力的文献保障。
2024年春，国际非遗大师、两岸文化使者许伯夷先生珍藏多年的台湾珍稀文献资料万余册入馆，包括台湾省政府时期的文献档案，以及台湾政治、经济、历史、文学等各类书籍、报刊文献，这些文献不仅记录了台湾的自然风貌、风土人情，更深刻反映了台湾在政治、经济、社会、文化等方面的历史变迁和发展轨迹。这些珍稀文献极大丰富了厦门大学台湾研究的文献馆藏，学校在此基础上设立了台湾文献珍藏馆。
台湾文献珍藏馆将以传承和弘扬中华文化、促进两岸文化交流、服务两岸融合发展为目标，发挥厦门大学深厚的学术底蕴和对台优势，未来将与两岸学术机构、专家学者开展紧密合作，致力于收集、整理、保存和展示台湾各类珍贵文献，努力建成深入了解台湾历史、文化和经济社会发展的文献信息平台，海峡两岸学术、文化交流的重要桥梁。台湾文献珍藏馆还将积极利用现代科技手段，推动文献资源的数字化和智能化，进一步扩大文献的影响力和利用价值。
台湾文献珍藏馆内设有专门的研究团队，开展台湾文献的深入研究和学术交流，挖掘文献中的价值，推动相关学术领域的发展。同时，还定期举办学术讲座、研讨会等活动，为师生提供一个了解台湾、研究台湾的重要平台。
