邓孔昭，1953年生，福建省三明市人。1978年厦门大学历史系毕业并留系任教，1982年到厦门大学台湾研究所工作，1986年任助理研究员，1991年任副研究员，1996年起兼任副所长，2000年任研究员，2004年被聘为厦门大学教授，厦门大学台湾研究院副院长至退休。
个人专著：
1、清代台湾史研究（与陈在正、孔立合著），厦门大学出版社，1985年11月，508页。
2、《台湾通史》辨误，江西人民出版社，1990年4月，350页。
3、《台湾通史》辨误（增订本），台湾自立晚报社文化出版部，1991年7月，422页。
4、台湾历史纲要（陈孔立主编，本人写作第3章并担任全书校订），九州出版社，1996年4月，505页。
5、郑成功与明郑台湾史研究，台海出版社，2000年2月，252页。 [1]
参与编撰：
1、台湾郑成功研究论文集（与孔立、陈在正合编），福建人民出版社，1982年6月，373页。
2、康熙统一台湾档案史料选辑（与陈在正、孔立等合编），福建人民出版社，1983年3月，338页。
3、郑成功档案史料选辑（与陈在正、孔立等合编），福建人民出版社，1985年6月，456页。
4、郑成功满文档案史料选译（与陈在正、孔立等合编），福建人民出版社，1987年9月，253页。
5、二二八事件资料集，台湾稻乡出版社，1991年2月，455页。
6、台湾研究论文精选（文史篇），台海出版社，2006年4月，576页。 [1]
发表论文：
1、试论1888年台湾彰化施九缎起事，厦门大学学报，1981年增刊。
2、1662---1683年清荷关系探讨，台湾研究集刊，1983年第2期。
3、中国近代外债的起始时间（与李承烈合作，本人执笔），中国社会经济史研究，1983年2期。
4、论姚启圣（与孔立、陈在正合作，本人执笔），台湾研究集刊，1984年第1期。
5、清政府对郑氏集团的招降政策及其影响，《郑成功研究论文选（续集）》福建人民出版社，1984年10月。
6、台湾八卦会和戴潮春起义，台湾研究集刊，1984年第4期。
7、清代台湾大小租的产生及其社会条件，厦门大学学报，1985年第1期。
8、试论台湾第二任巡抚邵友濂，台湾研究集刊，1985年第3期。
9、郑氏文武官田租税考，台湾研究集刊，1986年第1期。
10、姚启圣著述小考，台湾研究集刊，1987年第1期。
11、试论台湾二二八事件中的民主与地方自治要求，台湾研究集刊，1987年第2期。
12、试论郑成功对郑芝龙的批判与继承，台湾研究集刊，1987年第4期。
13、关于邵友濂尽废刘铭传新政的分析，《刘铭传在台湾》，上海社会科学院出版社，1987年4月。
14、《台湾通史》建国纪辨误，台湾研究集刊，1988年第2期。
15、从一首八闽童谣谈姚启圣为政清廉，福建论坛，1989年第6期。
16、忧患意识与台湾近代化，台湾研究集刊，1990年2、3期。
17、清政府禁止沿海人民偷渡台湾和禁止赴台者携眷的政策及其对台湾人口的影响，《台湾研究十年》，厦门大学出版社，1990年7月。
18、胡适之父战死台湾辨，台湾研究，1990年第3期。
19、连横与《台湾通史》，《海峡两岸文化交流史料》第1辑，华艺出版社，1990年。
20、台湾的漳籍移民与开漳圣王崇拜，台湾研究集刊，1992年第2期。
21、李光地、施琅、姚启圣与清初统一台湾，台湾研究集刊，1993年第1期。
22、从康熙前期福建会党活动的几条史料谈天地会起源，清史研究，1993年第1期。
23、评《荷据时代台湾史》，台湾研究集刊，1993年第2期。
24、光复初期台湾的行政长官公署制，台湾研究集刊，1994年第1期。
25、汉人向台湾移民是在荷兰人的推进下才开始的吗，《史明台湾史论的虚构》，人间出版社，1994年3月。
26、台湾史知识的惊人贫困—《台湾人四百年史》对历史知多少，《史明台湾史论的虚构》，人间出版社，1994年3月。
27、连横民众缔造历史思想述评，台湾研究，1994年第3期。
28、台湾建省初期的福建协饷，台湾研究集刊，1994年第4期。
29、陈仪的一生及其是非功过，明报月刊，1995年第4期。
30、陈编《刘壮肃公奏议》的若干问题，台湾研究集刊，1995年第3、4期。
31、明郑时期台湾社会经济若干问题的探讨，清史研究，1995年第4期。
32、郑成功收复台湾的战略运筹，中国军事科学，1996年第2期。
33、从卢若腾诗文看有关郑成功史事，台湾研究集刊，1996年第1期。
34、论清政府与台湾郑氏集团的谈判和援朝鲜例问题，台湾研究集刊，1997年第1期。
35、再论台湾二·二八事件，台湾研究论坛，1997年特刊。
36、清代前期关于台湾开发的一些不同主张，台湾研究集刊，1998年第1期。
37、子虚乌有的延平王国——论台湾国民中学教科书《认识台湾》（历史篇）对郑氏政权的杜撰，《<认识台湾>教科书评析》，九州出版社，1999年3月。
38、教科书怎能这样不注重史实的准确——论台湾国民中学教科书《认识台湾》（历史篇）第四章几处明显的史实错误，《<认识台湾>教科书评析》，九州出版社，1999年3月。
39、连横有“台湾独立”运动意识吗——评陈其南对《台湾通史》的错误解读，台湾研究集刊，1999年第4期。
40、郑成功在收复台湾斗争中所采取的几项战略措施，《郑成功研究》，中国社会科学出版社，1999年5月。
41、闽台历史文化研究的一本好书——评汪毅夫的《闽台历史社会与民俗文化》，台湾研究集刊，2001年第2期。
42、明郑时期台湾海峡海上交通问题的探讨，台湾研究集刊，2001年第4期；《海峡交通史论丛》，海风出版社，2002年1月。
43、郑成功收复台湾期间的粮食供应问题，台湾研究集刊，2002年第3期。
44、郑成功对金门社会历史的影响，《长共海涛论延平——纪念郑成功驱荷复台340周年学术研讨会论文集》，上海古籍出版社，2003年7月。
45、光复初期（1945－1949年）的台湾社会与文学，台湾研究集刊，2003年第4期。
46、台湾移民史研究中的若干错误说法，台湾研究集刊，2004年第2期。
47、明郑台湾建置考，台湾研究集刊，2004年第3期。
48、略论澎湖的历史地位，现代台湾研究，2004年第4期。
49、试论刘铭传的台湾建省方案，台湾研究集刊，2005年第4期。
50、郑成功在闽西北地区的抗清活动与延平王爵号由来的探讨，福建论坛（人文社会科学版），2005年第12期。
51、从电文往来看二·二八事件中的陈仪和蒋介石，台湾研究集刊，2006年第4期。
52、连横的郑成功研究及其对台湾抗日民族运动的影响，台湾研究，2007年第2期。
53、台湾建省与福建协饷，《台湾建省与抗日战争研究——纪念抗日胜利60周年暨台湾建省120周年学术研讨会论文集》，鹭江出版社，2008年7月。 [1]
其它著作：
1、福建省郑成功研究学术讨论会综述（与他人合作，本人执笔），光明日报，1982。8。16，3版。
2、 一九八五年台湾史研究综述，台湾研究集刊，1986年第1期。
3、郑芝龙，《清代人物传稿》上篇第四卷，中华书局，1987年4月。
4、郑成功与台湾，海峡两岸，1989年第2期。
5、毁誉参半的郑芝龙，文史知识，1990年第4期。
6、清代台湾的移民高潮，文史知识，1990年第4期。
7、《中国经济史词典》（赵德馨主编，本人写作明代、清代前期、近代部分有关台湾的辞条111条），湖北辞书出版社，1990年8月。
8、何斌，《清代人物传稿》上篇第六卷，中华书局，1991年4月。
9、厦门大学台湾研究所的台湾史研究，中国论坛，1991年8月号。
10、二·二八事件，台湾工作通讯，1993年第2期。
11、郑氏政权对台湾的经营，台湾工作通讯，1993年第7期。
12、近十几年来台湾史研究综述，《中国历史学年鉴1993》，三联书店，1994年6月。
13、连横学术成就暨学术思想讨论综述，文科研究通报，1995年第1期。
14、海峡两岸的郑成功研究，泉州晚报（海外版），1999。9。18第3版。
15、台湾史纲要（田珏主编，本人写作第四章第一、二节），福建人民出版社，2000年5月。
16、洗刷耻辱台湾光复，厦门日报，2001。10。25。
17、《康熙帝国》：仍是戏说——谈清初统一台湾的历史事实，两岸关系，2002年2月（总第56期）。
18、运筹帷幄克敌制胜——郑成功收复台湾的战略与战术，炎黄纵横，2002年第1期。
19、郑成功与金门，厦门日报，2002年2月1日第20版。
20、从特殊角度观察记载郑成功收复台湾——读新近出版的《梅氏日记》有感，泉州晚报（海外版），2003年7月29日第3版。
21、台湾是中国领土不可分割的一部分——纪念台湾光复59周年，人民日报，2004年10月26日第4版。
22、清代台湾史研究综述，《台湾研究论文精选（文史篇）》，台海出版社，2006年4月出版。
23、二·二八事件六十周年祭，两岸关系，2007年第2期（总116期）。
24、涉台文化资源的保护和闽台文化交流的一些体会与思考，福建省文化厅编：《海西文化遗产 两岸历史记忆——海峡西岸文化遗产保护论坛（2007）论文集》，福建省地图出版社，2008年9月。
25、经历台湾史研究30年，台湾研究，2009年第2期。
